如果您的快递在运输过程中被掉包，您可以采取以下措施：
拒收快递
如果发现商品被调包，您可以选择拒收快递，并在已签字的快递单上明确标注拒收的原因和理由。
部分损坏或不齐全
如果商品只是部分损坏或不齐全，您可以在快递单上声明异议的情况下收货，然后联系商家进行处理。
投诉快递公司
您可以通过以下方式投诉快递公司：
访问快递公司的官方网站，找到投诉与建议页面，按照提示进行投诉。
拨打快递公司的投诉电话，直接进行电话投诉。
如果涉及金额较大，您还可以选择报警处理。
法律途径
根据《民法典》第八百三十二条和第八百三十三条，承运人对运输过程中货物的毁损、灭失承担赔偿责任，除非能证明货物毁损、灭失是因不可抗力、货物本身的自然性质或者合理损耗以及托运人、收货人的过错造成的。
您可以依据《中华人民共和国邮政法》第四十七条要求快递公司进行赔偿。根据该法，如果邮件保价，则按照保价额赔偿；如果未保价，则按照实际损失赔偿，但最高赔偿额不超过所收取资费的三倍。
收集证据
在发现快递被掉包后，您应立即收集相关证据，如快递单、商品照片、监控录像等，以便在需要时提供证明。
联系商家
如果商品是通过商家邮寄的，您可以直接联系商家，要求商家进行处理，如补发或退款。
报警
如果快递丢失且涉及金额较大，您可以选择报警，警方会协助您调查并可能帮助您找到责任人。
通过以上措施，您可以有效地维护自己的权益。建议您在邮寄重要文件或高价值商品时，选择有信誉的快递公司，并进行保价，以减少风险。
